首先菇房应选择建在地势高燥，排水方便，周围环境清洁而开旷，远离鸡棚、仓库及饲料间、近水源。并有堆料场地的地方。
菇房的方向是坐北朝南（东西横向）。这样有利于通风换气，又可提高冬季室温，避免春、秋季节干热的西南风直接吹到菌床，并可减少日晒。
为了便于管理，新建菇房的面积不宜过大或过小。菇房过大通风换气不均匀，（骐成蘑菇栽培通风风机）温湿度难以控制，杂菌、病虫容易发生和蔓延；栽培面积过小，则利用率不高，成本大。一般每间菇房栽培面积以160－220平方米为宜。
设置五层床架的菇房，从地面到屋檐为2－3m，屋顶高度以上层床面到屋顶的屋脊2m为宜，以利通风换气。菇房长约9m，进深以6－7m为宜。过深菇房中部通风不良；过浅则利用率不高，而且不利于保湿。
菇房的墙壁、屋面要求稍厚些，可以减轻气温突然变化对蘑菇生长的不利影响。一般墙厚30－36cm。地面和四壁宜光洁、坚实，用石灰粉刷，以防害虫躲藏，所有漏风处要堵塞，利于消毒和保温、保湿。
利用菇房能够为食用菌的生长创造适宜的环境条件。在新建菇房时，必须根据食用菌对环境条件的要求，慎重考虑，周密设计。菇房要求通风换气良好，保温、保湿性能好，冬暖夏凉，风吹不到菌床上。室内不易受外界条件变化的影响，便于清洗；有利于防治杂菌及病虫。具体原则如下：
① 空间比例：空间比是指菇房内空气流通的空间与菇床面积之比。理想的食用菌生长发育的空间比应为51,空间比过小，无法及时排出蘑菇生长时所产生的二氧化碳和其它废气，易造成幼菇**或形成畸形菇而减产；空间比过大，菇房不易保温和保湿。
② 屋顶斜度：如果菇房屋顶斜度不够，屋顶凝结水下滴造成上层菇床堆肥过湿，并影响出菇和产量。合理的屋顶斜度应是屋顶三角架的高与菇房的宽度之比为14.73。
③ 单元面积：蘑菇工厂化生产的菇房出菇面积一般在500平方米左右。我国的蘑菇栽培方式绝大部分是在自然条件下一年栽培一茬，单间菇房的栽培面积要考虑当地气候条件、操作简便省力和有利于鲜菇销售等因素。根据目前实际情况，单间菇房的栽培面积以200～250平方米为宜。
④ 保温性：菇房一方面要防止热气外流（如培养料后发酵），另一方面要不让外面冷热空气侵入。故要求保温性好。
⑤ 密闭性：菇房的门窗设计要做到开能放，关能闭。开能放可保证菇房内的废气和多余热量及时排出，关能闭能使菇房保温、保湿和防止害虫侵入。
⑥ 通气性：既要使菇房内的废气及时排出，又能使外界新鲜空气迅速进入茹房，所以，菇房要求开设地脚窗和屋顶气窗。
⑦安全性：菇房长期处于潮湿的环境之中，菇房要承担每平方米70～80千克的培养料和覆土的重量，所以菇房和床架要搭建牢固。菇房地面要整平，铺设水泥地；柱脚架必须垫平，避免在软质沙土上搭建；要采用成熟毛竹或硬质木作为菇架材料；用电设备要请电工合理安装。
